Kai kurių gyvūnų išnykimo problema nėra paskutinė vieta evoliucijos teorijoje ir yra nepaprastai svarbi mokant Darvino. Šiuo metu gyvenančių rūšių skaičius užima tik nereikšmingą dalį viso kada nors planetoje pasirodžiusio gyvūnų skaičiaus (mažiau nei 1%). Pagaliau išmirė 99% kategorijų, ir tam yra daugybė priežasčių.
Labiausiai jautrūs išnykimui yra gyvūnai, randami vienoje ar keliose vietose geografiškai ribotose vietovėse. Jei visas arealas patyrė žmogaus veiklą, jame gyvenančios rūšys gali išnykti. Tiesioginė kai kurių rūšių gyvūnų išnykimo natūraliomis sąlygomis priežastis yra jų skaičiaus sumažėjimas žemiau kritinės ribos, nustatytos populiacijos genetikos dėsnių. Kritinis yra gausos lygis, žemiau kurio tampa glaudžiai susijusios kryžminimo galimybės, dėl ko sumažėja genetinė rūšių įvairovė. Dėl to yra dalis palikuonių, turinčių įgimtų sutrikimų, didinančių mirtingumą naujose kartose. Rūšys, susiformavusios dėl vienos ar kelių populiacijų, taip pat greitai išnyksta. Bet kuri kategorija gali išnykti dėl gaisrų, žemės drebėjimų, ligų ir žmogaus veiklos. Skirtingos populiacijos kategorijos yra mažiau linkusios išnykti, palyginti su mažais, dideli gyvūnai turi didžiules atskiras teritorijas. Jiems reikia daug maisto, jie dažnai tampa žmonių grobiu. Stambūs gyvūnai yra labiau linkę sunaikinti ne tik dėl to, kad yra grobis, bet ir dėl to, kad medžiojant medžiojamus gyvūnus jie varžosi su žmonėmis, kartais puola žmones ir gyvulius. Jie taip pat linkę išnykti, jei sunaikinama dalis jų arealo. Natūraliai vystantis gamtai, aplinkos pokyčiai priverčia kai kurias kategorijas prisitaikyti prie naujų sąlygų. Gyvūnai, negalintys prisitaikyti, yra priversti migruoti į tinkamas buveines. Priešingu atveju jų rūšims gresia išnykimas. Spartus gamtos išteklių vystymosi tempas lenkia prisitaikymą, paliekant migraciją kaip vienintelę galimybę. Gyvūnų, negalinčių kirsti laukų, kelių ir kitų sutrikdytų buveinių, kategorijos yra pasmerktos išnykti. Utilitarizmas visada buvo būtina sąlyga išnykti labai vertingoms gyvūnų rūšims. Per didelis išnaudojimas gali smarkiai sumažinti populiacijos dydį. Jei medžioklė nėra reglamentuota įstatymais, tam tikri gyvūnų tipai gali būti ant išnykimo ribos.
